Hemm diversi apparati għas-sinteżi tal-librerija tal-peptidi, bħas-sintetizzatur tal-librerija tal-peptidi kompletament awtomatika Apex 396HT. Dawn l-apparati jistgħu awtomatikament jippreparaw u jaqtgħu libreriji tal-peptidi, u b'hekk itejbu l-effiċjenza u r-rendiment tas-sintesi.