Glossarju

2-Abz - 2-Aminobenzoyl, normalment jgħaqqad ma' 2,4-dinitrophenyl (Dnp) jew 3-nitro-tyrosine (NitroTyr) biex jiffurmaw pari Fluorophore/Quencher. eċċitazzjoni f'320 nm, emissjoni f'420 nm.

3-Abz (aċidu m-aminobenzoic) jista' jitqies bħala -amino acid. Meta l-aċidu m-aminobenzoic jiġi inkorporat fil-ktajjen tal-peptidi, jirriżulta f'dawra riġida.

4-Abz (aċidu p-Aminobenzoic, PABA), li huwa derivattiv tal-aċidu benżojku li jseħħ b'mod naturali, jista' wkoll jiġi utilizzat bħala spacer lineari riġidu.

Abu, L- -Aminobutyryl ((S)-2-Amino-butanoyl), -aminobutyric acid, huwa derivattiv ta' aċidu amminiku. Minħabba x-xebh strutturali tiegħu ma 'aċidi amminiċi naturali, ħafna drabi jintuża fid-disinn u s-sintesi ta' peptidi u mimetiċi tal-peptidi.

Ac jirrappreżenta aċetil. L-aċetilazzjoni N-terminal hija modifika ta 'stabbilizzazzjoni komuni għal peptidi fin-natura.

Acm, Acetamidomethyl, jista 'jitneħħa bl-użu ta' Hg(II) jew Ag(I). Huwa wieħed mill-gruppi li jipproteġu thiol komunement użati għaċ-ċisteina meta jiġu sintetizzati peptidi b'bonds multipli disulfide.

ACTH (ormon adrenokortikotropiku) huwa ormon imnixxi mill-pitwitarja anterjuri li jistimula l-kortiċi adrenali biex jipproduċi kortikosterojdi.

Aad (aċidu L- -aminoadipic) huwa aċidu amminiku mhux proteinoġeniku. L-istruttura tiegħu hija simili għall-aċidu glutamiku (Glu), bi grupp ta 'metilin addizzjonali fil-katina tal-ġenb tiegħu.

L-aċidu (2-Aminoethoxy)acetic, magħruf ukoll bħala glycine ethyl ester jew glycine ethylamide, jista 'jintuża bħala spacer jew linker fis-sinteżi tal-modifika tal-peptidi.

1-(1'-adamantil)-1-methyl-ethoxycarbonyl, grupp li jipproteġi l-amino labili ħafna mill-aċidu fis-sintesi tal-peptidi, jista' jiġi deprotett bi 3% TFA/CH2Cl2

AFC (7-Amino-4-trifluorometilkumarin) huwa kompost fluworexxenti b'eċitazzjoni tal-kumarina rilaxxata f'395-400 nm, emissjoni fi 495-505 nm.

Speċi ta 'piż molekulari ogħla huma ffurmati minħabba l-adeżjoni mhux kovalenti ta' speċi iżgħar. Fil-proteini b'mod partikolari, l-aggregazzjoni hija forma ta 'denaturazzjoni li tista' sseħħ fuq uċuħ mhux polari bi strutturi sekondarji, bħal dawk li tipikament jiffurmaw interazzjonijiet intramolekulari u huma midfuna fil-helizes u l-folji tal-proteina. Molekuli jinteraġixxu ma 'xulxin, xi kultant jiffurmaw forom polimolekulari li ma jinħallux. L-aggregazzjoni tikkuntrasta mal-oligomerizzazzjoni, l-interazzjoni normali ta 'proteini nattivi mitwijin b'mod korrett biex jiffurmaw polimeri ta' ordni ogħla.

AHX, Aminohexanoyl,6-amino hexanoic acid, imqassar ukoll Aca jew LC, Tipikament introdott bħala spacer qasir mhux polari bejn il-bijotina, il-fluworofori u s-sekwenzi tal-peptidi.

2-Aċidu aminoisobutyric huwa aċidu amminiku rari mhux proteini li huwa prodott finali tal-metaboliżmu tal-pirimidina u jitneħħa fl-awrina u huwa preżenti f'xi antibijotiċi ta 'oriġini fungali. Użat ukoll biex jissostitwixxi aċidi amminiċi naturali għas-sintesi tal-peptidi.

L-alkoħol huma dawk il-komposti organiċi li huma kkaratterizzati mill-preżenza ta' grupp idrossiliku wieħed, tnejn jew aktar (-OH) li huma mwaħħla ma' l-atomu tal-karbonju fi grupp alkil jew katina ta' idrokarburi. L-alkoħol peptidiku huma komposti klinikament kruċjali li mhumiex investigati biżżejjed fl-istudji tar-relazzjoni struttura-attività (SAR) għall-iskoperta tad-droga. Pereżempju, DAMGO huwa agonist tar-riċettur tal-opjojdi modifikat mill-alkoħol fis-C-terminal, bis-sekwenza ta 'Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. Għandu selettività u affinità għolja għar-riċettur μ-opjojdi.

Aldehyde huwa kompost organiku li fih il-grupp karbonil huwa mwaħħal ma 'atomu tal-karbonju fit-tarf ta' katina tal-karbonju. Peptide aldehydes huma għodod importanti fil-bijokimika u l-bijoloġija kimika għall-inibizzjoni u d-diżabilitazzjoni kimika tal-proteases.

Aloc - Allyloxycarbonyl, grupp li jipproteġi l-amino (imqassar ukoll Alloc). Il-protezzjoni tista' titneħħa b'Pd(PPh3)4.

Il-marda ta 'Alzheimer, immarkata minn plakek -amyloid u tau tangles, tirriżulta minn disfunzjoni sinaptika u kwistjonijiet ta' passaġġ ta 'tneħħija, li tikkawża indeboliment konjittiv.

7-Amino-4-methylcoumarin (AMC) hija sonda fluworexxenti komuni għall-ittikkettjar tal-peptidi fi studji tal-protease. Il-konjugazzjoni tiegħu ma' peptide jaqta' s-sinjal fluworexxenti, u l-AMC rilaxxat mal-qsim tal-protease jista 'jikkwantifika l-attività ta' l-enżimi, b'massimi ta 'eċċitazzjoni/emissjoni ta' 345/445 nm. Pereżempju, il-peptide fluworexxenti tas-sottostrat preferut għad-determinazzjoni tal-attività simili tat-tripsina ta 'proteasome purifikat, bis-sekwenza: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

Peptide natriuretiku atrijali (ANP), ormon prodott u rilaxxat mill-atria tal-qalb b'reazzjoni għal żieda fil-volum tad-demm u l-pressjoni. Jiffunzjona biex jirregola l-bilanċ tal-fluwidu u l-pressjoni tad-demm billi jippromwovi l-vażodilatazzjoni, iżid il-produzzjoni tal-awrina (dijureżi), u jnaqqas ir-riassorbiment tas-sodju fil-kliewi. Dawn l-azzjonijiet jgħinu biex jikkontrobattu l-effetti ta 'pressjoni tad-demm għolja u tagħbija żejda ta' fluwidu fil-ġisem.

Il-peptidi antiġeniċi huma sekwenzi qosra ta' aċidi amminiċi derivati ​​minn proteini jew bijomolekuli oħra li jikkawżaw ir-rispons immuni ta' organiżmu. Dawn il-peptidi huma rikonoxxuti mis-sistema immunitarja bħala barranin jew barranin għall-ġisem, li jwasslu għall-attivazzjoni ta 'ċelluli immuni bħal ċelluli T u ċelluli B. Il-peptidi antiġeniċi għandhom rwol kruċjali fir-risponsi immuni, inkluża l-produzzjoni adattiva tal-antikorpi u l-iżvilupp tal-memorja immuni. Huma studjati ħafna fl-immunoloġija u l-iżvilupp tal-vaċċini minħabba l-potenzjal tagħhom li jqanqlu risponsi immuni speċifiċi kontra patoġeni jew ċelluli anormali.

Is-sinteżi ta 'peptidi asimmetriċi b'2, 4, u 8 fergħat tista' tinkiseb billi ddaħħal strateġikament lysine, arginine, jew aċidu glutamiku fis-sekwenza tal-peptide.

Dimethylarginine asimmetriku (ADMA, Arg(Me)2) huwa kompost kimiku li jseħħ b'mod naturali u inibitur endoġenu ta 'nitric oxide synthase (NOS). Fmoc-Arg(Me)2-OH (assimetriku) jista 'jintuża direttament għas-sintesi ta' peptidi li fihom dimethylarginine asimmetriku.

5-Aċidu aminovaleric, jista 'jintuża bħala spacer jew linker fis-sinteżi tal-modifika tal-peptidi.

Benzyloxymethyl (Bom) huwa grupp li jipproteġi l-imidazole aċidu labili użat fil-proċess Boc-SPPS għal peptidi li fihom l-istidina. Benzyloxymethyl jipproduċi formaldehyde reattiv ħafna wara t-trattament bl-aċidu. Għalhekk, Bom huwa l-aħjar maqsuma fil-preżenza ta 'Cys, methoxyamine jew komposti oħra li jirreaġixxu ma' aldeidi.

-aċidi amminiċi għandhom il-grupp amminiku tagħhom imwaħħal mal--karbonju, li huwa t-tieni atomu tal-karbonju 'l bogħod mill-grupp karbossiliku. Il-formula strutturali ġenerali għal -amino acid tista 'tiġi rappreżentata bħala: R-CH(NH2)-COOH

Peptidu natriuretiku tat-tip B (BNP), ormon prodott prinċipalment mill-ventrikoli tal-qalb bi tweġiba għal tiġbid eċċessiv taċ-ċelloli tal-muskoli tal-qalb. Huwa għandu rwol kruċjali fir-regolazzjoni tal-pressjoni tad-demm u l-bilanċ tal-fluwidu, primarjament billi jippromwovi l-vażodilatazzjoni u jżid l-eskrezzjoni tas-sodju permezz tal-kliewi.

t-Butyloxycarbonyl (Boc) huwa grupp li jipproteġi ħafna aċidu-labilea -amino fis-sintesi tal-peptidi, jista 'jinqasam minn TFA/klorur tal-metilin (1:1), HCl f'aċetat etiliku jew dioxane, 98% aċidu formiku.

2-(4-Biphenylyl)isopropyloxycarbonyl (Bpoc) huwa grupp li jipproteġi ħafna aċidu-labilea -amino fis-sinteżi tal-peptidi, jista 'jinqasam b'1% TFA/klorur tal-metilin.

Peptidi b'2, 4, u 8 fergħat jistgħu jinkisbu billi ddaħħal b'mod strateġiku lysine, arginine, jew aċidu glutamiku fis-sekwenza tal-peptidi.

t-Butyldimethylsilyl (TBS jew TBDMS) huwa grupp li jipproteġi l-idroksil kompatibbli ma 'Fmoc-SPPS. Huwa aċidu-labili u jista 'jinqasam b'mod selettiv minn joni tal-fluworidu.

Benzoyl huwa grupp acyl spiss introdott fit-tarf N tal-peptidi. Huwa inqas polari minn acetyl (Ac) u jista 'jkun bħala modifika permanenti.

Benzyl (Bzl) residwu tal-alkil u grupp protettiv tal-katina tal-ġenb użat għall-imblukkar tal-alkoħol (Ser, Thr, Hyp) fis-sintesi tal-peptidi. huwa jista 'jinqasam b'aċidi qawwija jew idroġenoliżi katalitika (eż. idroġenu/Pd).

Cholecystokinin (CCK) huwa ormon peptide prodott mill-mukuża tal-musrana ta 'fuq u misjub fis-sistema nervuża ċentrali. Jistimula l-kontrazzjoni tal-marrara, ir-rilaxx tal-enżimi tal-frixa, u jinfluwenza diversi proċessi gastrointestinali.

Il-peptide relatat mal-ġene tal-kalċitonin (CGRP) huwa 37-peptide ta' aċidu amminiku relatat ma' calcitonin, amylin, u adrenomedullin. Jeżisti f'żewġ forom, -CGRP (CGRP I) u -CGRP (CGRP II), b'attivitajiet bijoloġiċi simili. CGRP jinstab primarjament fin-newroni sensorji u ċentrali, li jinfluwenza l-funzjoni kardjovaskulari, il-metaboliżmu tal-kalċju u t-ton vaskulari fetoplaċentali. Ir-riċetturi tiegħu huma akkoppjati mal-proteini G u jattivaw adenylate cyclase, jinteraġixxu ma 'proteini li jimmodifikaw l-attività tar-riċettur (RAMPs) għall-ispeċifiċità tal-ligand u t-traffikar ċellulari.

L-Cyclohexylalanine (Cha) huwa analogu ta 'aċidu amminiku mhux polari ta' phenylalanine, fejn iċ-ċirku aromatiku jiġi sostitwit b'ċirku cyclohexane. Din is-sostituzzjoni tippermetti li tistudja r-rwol ta 'aċidi amminiċi aromatiċi f'interazzjonijiet bħal interazzjonijiet π-π billi tissostitwixxi residwi ta' fenilalanina ma 'Cha f'esperimenti.

L- -Cyclohexylglycine (Chg) huwa aċidu amminiku mhux polari li huwa mfixkel b'mod steriku. Iservi bħala intermedjarju farmaċewtiku sinifikanti u jinstab ukoll fi prodotti naturali.

Il-kolesterol huwa prodott b'mod naturali mill-fwied u ċelluli oħra fil-ġisem, iżda jista 'jiġi wkoll mill-ikel li nieklu, speċjalment minn prodotti tal-annimali bħal laħam, tjur, u prodotti tal-ħalib b'xaħam sħiħ. Il-kolesterol jista 'jkun marbut ma' peptidi biex itejjeb il-farmakokinetika.

cis-Hydroxyproline, l-isterjoisomer tat-trans-hydroxyproline naturali.

Citrulline huwa preżenti fil-proteini bħala riżultat ta 'modifika enżimatika ta' wara t-traduzzjoni ta 'residwi ta' arginine.

CMK huwa inibitur RSK2 kinase b'qawwa simili iżda inqas stabbiltà kimika minn FMK.

Il-peptide natriuretiku tat-tip C (CNP) huwa peptide minn ċelluli endoteljali vaskulari, magħruf għall-effetti vażodilatorji tiegħu. Jesibixxi xebh strutturali u fiżjoloġiku ma' peptidi natriuretiċi atrijali u tal-moħħ (ANP u BNP).

L- -Cyclopentylglycyl (Cpg), huwa aċidu amminiku mhux polari li huwa mxekkel sterikament.

Fis-sekwenza tal-peptide, dak ir-residwu uniku li huwa konness mas-sekwenza lineari mill-grupp amminiku tiegħu, u jħallih bi grupp karbossiku ħieles. Il-grupp karbossiliku ta 'dan ir-residwu jista' jgħaddi minn modifiki bħal amidazzjoni jew, f'każijiet bħal piroglutamat, lattamizzazzjoni interna.

Cyanine 3 huwa żebgħa taċ-ċjanina aħmar-fluworexxenti komunement eċċitati minn sors tad-dawl madwar 558 nm u li jarmi dawl f'madwar 572 nm.

Cyanine 5 huwa fluworofor taż-żebgħa taċ-ċjanin li jarmi fluworexxenza qrib infra-aħmar komunement eċċitati minn sors tad-dawl madwar 646 nm u li jarmi dawl f'madwar 664 nm.

L- , -Diaminobutyric acid huwa ,ω-diamino acid, analogu iqsar ta 'ornithine (Orn) u lysine (Lys). Bi protezzjoni xierqa, l-aċidi ,ω-diamino jistgħu jiġu modifikati b'mod selettiv fil-pożizzjoni Nω tagħhom jew inkorporati biex joħolqu peptidi jew dendrimeri ramifikati.

3-(Dimethylaminoazo)benzene-4-carboxylic acid, huwa kromoforu marbut ma' gruppi amminiċi użati fl-applikazzjonijiet tal-bijokimika u tal-bijoloġija molekulari bħala quencher fit-trasferiment tal-enerġija tar-reżonanza tal-fluworexxenza (FRET), eż. ma' EDANS. Eċitazzjoni ta 'DABCYL f'454 nm.

Dabsyl ,4-dimethylaminobenzenesulfonyl chloride, Kromoforu marbut ma' gruppi amminiċi użati bħala quencher flimkien, eż. ma' EDANS. Eċitazzjoni ta' Dabsyl f'436 nm.

4-Dimethylamino-1-naphthalene-sulfonyl, fluworofor marbut ma' gruppi amino, eċċitazzjoni f'342 nm, emissjoni f'562 nm.

L- , -Diaminopropionic acid (Dap jew Dpr) huwa ,ω-diamino acid, li huwa analogu iqsar ta 'aċidu diaminobutyric (Dab), ornithine (Orn), u lysine (Lys). Derivattivi modifikati ta 'aċidi ,ω-diamino jistgħu jiġu mibdula b'mod selettiv fil-pożizzjoni Nω tagħhom jew inkorporati biex joħolqu peptidi ramifikati jew dendrimeri.

1-(4,4-Dimethyl-2,6-dioxocyclohex-1-ylidene)ethyl (Dde) huwa grupp li jipproteġi l-amino użat fis-sintesi tal-peptidi. Jista 'jinqasam b'mod selettiv bl-użu ta' 2% hydrazine hydrate f'dimethylformamide (DMF). Nω-Dde jippermetti t-tneħħija speċifika ta 'Dde minn aċidi amminiċi bħal Dap, Dab, Orn, jew Lys wara sinteżi ta' peptidi f'fażi solida Fmoc (SPPS), li tiffaċilita l-modifika fuq ir-reżina tal-grupp Nω-amino.

Ir-rabtiet disulfide huma rabtiet kovalenti ffurmati bejn żewġ gruppi ta 'sulfhydryl (-SH) ta' residwi ta 'cysteine ​​fil-proteini.

2,4-dimethoxybenzyl huwa grupp li jipproteġi l-formamide aċidu labili użat għall-modifika riversibbli tas-sinsla fis-sintesi tal-peptidi. Huma inkorporati matul is-sintesi tal-peptidi tal-fażi solida (SPPS) bħala l-aċidu amminiku jew dipeptide Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), fejn Fmoc jipprevjeni l-aggregazzjoni tal-peptidi u għalhekk jippromwovi elongazzjoni effiċjenti. Dmb jippromwovi wkoll reazzjonijiet ta 'ċiklizzazzjoni u jipprevjeni l-formazzjoni ta' asparagimide. B'differenza mid-derivattivi Hmb, Dmb ma jifformax benzoxazepines waqt l-attivazzjoni.

2,4-Dinitrophenyl huwa kromoforu li huwa konjugat ma' gruppi amino, komunement użat bħala quencher fis-sottostrati tat-trasferiment tal-enerġija tar-reżonanza tal-fluworexxenza (FRET).

4,4′-Dimetoxydityl, magħruf ukoll bħala bis-(4-methoxyphenyl)methyl, huwa grupp protettiv ta 'carboxamide aċidu-labili li huwa kompatibbli mas-sintesi tal-peptidi f'fażi solida Fmoc (SPPS).

DOPA, 3,4-dihydroxyphenylalanine, huwa prekursur għal diversi newrotrasmettituri kruċjali, inklużi dopamine, norepinephrine, u epinephrine.

(4,7,10-Tricarboxymethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecyl)-aċidu aċetiku, imqassar bħala DOTA, huwa kelatur ċikliku tipikament imwaħħal mal-N-terminal tal-peptidi. DOTA tiffaċilita l-ittikkettjar ta 'peptidi b'radjonuklidi bħal 68Ga jew 90Y għal diversi applikazzjonijiet bijomediċi, inklużi immaġini u terapija mmirata.

Diphenylmethyl (dityl), grupp li jipproteġi N-, O-, u S-aċidu labili.

L-aċidu diethylenetriaminepentaacetic (DTPA) huwa aġent kelanti utli għal radjonuklidi bħal (68)Ga, (99m)Tc u (111)In, li huma applikabbli għall-immaġini tal-mediċina nukleari.

5-[(2-Aminoethyl)amino]naphthalene-1-sulfonic acid (EDANS) huwa fluworofor komunement marbut man-Nω ta' aċidi dijamino bħall-lisina. Huwa użat ta 'spiss f'sottostrati FRET, tipikament imqabbla ma' quenchers bħal DABCYL. EDANS għandu wavelength ta 'eċitazzjoni ta' 340 nm u jarmi f'490 nm.

Polipeptide endoteljali li jattiva l-monoċiti.

L-etil, grupp alkil u omologu tal-metil (Me), jintuża għal modifiki permanenti ta 'N- u S-ethylation fil-peptidi.

L-immappjar tal-epitopi (mapping tal-epitopi tal-antiġenu) huwa teknika użata biex tiddetermina ż-żoni speċifiċi (jiġifieri, epitopi tal-antiġeni) fuq antiġenu li jista 'jiġi rikonoxxut mill-antikorpi jew mis-sistema immuni. Epitopi antiġeni jistgħu jinqasmu f'epitopi lineari u epitopi konformazzjonali. Permezz tal-immappjar tal-epitopi tal-antiġenu, nistgħu nifhmu fil-fond ir-relazzjoni bejn l-istruttura u l-funzjoni tal-antiġen, li hija ta 'sinifikat kbir fl-iżvilupp tal-vaċċini, id-dijanjosi tal-mard, l-immunoterapija u aspetti oħra.
Uħud mill-metodi ta 'mappjar tal-epitopi tal-antiġen użati komunement jinkludu:
Kristallografija tar-raġġi X: Tista 'tanalizza direttament l-istruttura tridimensjonali tal-antiġen, u b'hekk tiddetermina l-pożizzjoni tal-epitope.
Reżonanza manjetika nukleari: Tista 'tintuża wkoll biex tanalizza l-istruttura tal-antiġen biex tiddetermina l-epitope.
Teknika ta 'skannjar tal-peptidi: L-użu ta' serje ta 'segmenti ta' peptidi sintetiċi li jikkoinċidu biex jidentifikaw l-epitope li jingħaqad mal-antikorp.
Pereżempju, fir-riċerka u l-iżvilupp tal-vaċċini, il-kjarifika tal-epitopi ewlenin fuq l-antiġen jgħin biex jitfasslu vaċċini aktar effettivi u jinduċi rispons immuni aktar immirat; fid-dijanjosi tal-mard, id-determinazzjoni tal-epitopi tal-antiġeni relatati ma 'mard speċifiku tista' tiżviluppa reaġenti dijanjostiċi aktar preċiżi.

5-FAM (5-Carboxyfluorescein) huwa fluworofor użat komunement għat-tikkettar ta' bijomolekuli, b'tul ta' mewġ ta' eċċitazzjoni ta' 490 nm u emissjoni f'520 nm.

Fluorescein-6-carbonyl huwa fluworofor imwaħħal ma' gruppi amino, b'tul ta' mewġ ta' eċċitazzjoni ta' 490 nm u emissjoni f'520 nm.

Fluorescein isothiocyanate (FITC) huwa fluorophore li jirreaġixxi ma 'gruppi amino. Meta ttikkettar peptide fit-tarf N tiegħu b'FITC, komunement jiddaħħal spacer bħal -alanine jew Ahx. FITC għandu wavelength ta 'eċitazzjoni ta' 490 nm u emissjoni f'520 nm.

9-Fluorenylmethyl huwa grupp ta' protezzjoni bażi-labbli użat għall-protezzjoni O- u S-.

FMK, fluoromethyl ketone, huwa inibitur irriversibbli ta 'RSK2 kinase.

9-Fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), il-grupp li jipproteġi l-amino fis-sintesi tal-fażi solida FMOC, jista 'jitneħħa b'20% piperidine/DMF.

Formyl huwa grupp li jipproteġi l-indol użat f'Boc-SPPS. Trp(For) jinqasam minn HF fil-preżenza ta' mercaptan jew minn bażijiet bħal piperidine.

It-trasferiment tal-enerġija tar-reżonanza tal-fluworexxenza (FRET) huwa t-trasferiment ta 'enerġija mhux radjattiva minn fluorophore eċċitati (donatur) għal aċċettatur adattat (quencher). It-trasferiment jiddependi fuq id-distanza, l-orjentazzjoni tad-dipole, u l-koinċidenza spettrali tad-donatur u l-aċċettatur. Fis-sottostrati FRET, il-fluworophore u l-quencher huma marbuta permezz ta 'katina peptide. Il-qsim enżimatiku jżid il-fluworexxenza billi jissepara d-donatur u l-aċċettatur.

Il-fluworexxenza hija d-dawl li joħroġ minn sustanza li tassorbi d-dawl jew radjazzjoni elettromanjetika oħra. Dan iseħħ meta molekuli msejħa fluorophores jassorbu fotoni ta 'wavelength speċifiku, isiru eċċitati, u mbagħad jarmu fotoni u jerġgħu lura għall-istat fundamentali tagħhom. Id-dawl emess tipikament ikollu wavelength itwal u enerġija aktar baxxa mid-dawl assorbit, li jirriżulta fi spettru ta 'fluworexxenza karatteristika. Dan il-fenomenu huwa użat ħafna għal varjetà ta 'skopijiet xjentifiċi u mediċi, inklużi mikroskopija, ċitometrija tal-fluss, u spettroskopija ta' fluworexxenza.

Polipeptid inibitorju gastriku (GIP), magħruf ukoll bħala peptide insulinotropiku dipendenti fuq il-glukożju, jappartjeni għall-familja ta 'l-ormoni secretin. Jistimula s-sekrezzjoni tal-insulina, jinibixxi s-sekrezzjoni tal-aċidu gastriku, u għandu rwol kruċjali fir-regolazzjoni tas-sekrezzjoni tal-insulina u l-omeostasi tal-glukożju.

L- -Aċidu karbossiglutamiku (Gla) huwa ffurmat permezz tal-karbossilazzjoni ta 'wara t-traduzzjoni ta' aċidu glutamiku, li jirriżulta fi proteini li kapaċi jorbtu joni tal-kalċju, bħall-osteocalcin. Il-peptidi li fihom il-Gla huma idealment sintetizzati bl-użu ta 'sinteżi ta' peptidi f'fażi solida Fmoc (SPPS), peress li Gla jista 'jgħaddi minn decarboxylation biex jagħti aċidu glutamiku fil-preżenza ta' aċidi qawwija.

Peptidi li jixbħu l-glucagon huma membri tas-superfamilja tal-glucagon ta 'ormoni peptidi derivati ​​mir-reġjun C-terminal tal-proglucagon. Huma primarjament sintetizzati minn ċelluli L intestinali.

L-ormon li jirrilaxxa l-gonadotropin (LHRH) huwa ormon decapeptide prodott f'ċelloli newrosekretorji ipotalamiċi u rilaxxat f'fqigħ pulsatili fiċ-ċirkolazzjoni tal-portal pitwitarja. Is-sekrezzjoni pulsatili hija kritika għall-funzjonijiet riproduttivi, l-iżvilupp sesswali, u d-divrenzjar.

L-ormon li jirrilaxxa l-ormon tat-tkabbir (GHRH), magħruf ukoll bħala somatorelin, huwa ormon peptide ipotalamiku li jistimula l-glandola pitwitarja biex tirrilaxxa u tisintetizza l-ormon tat-tkabbir.

L-ormon li jirrilaxxa l-ormon tat-tkabbir (GHRH), magħruf ukoll bħala somatorelin, huwa ormon peptide ipotalamiku li jistimula l-glandola pitwitarja biex tirrilaxxa u tisintetizza l-ormon tat-tkabbir.

Antiġen tal-lewkoċiti umani (HLA) jirreferi għal grupp ta 'proteini misjuba fuq il-wiċċ taċ-ċelloli li għandhom rwol kruċjali fir-rikonoxximent tas-sistema immuni ta' sustanzi barranin. Huma kodifikati mill-ġeni tal-kumpless tal-istokompatibilità maġġuri (MHC) fil-bnedmin u huma essenzjali għall-preżentazzjoni ta 'antiġeni għaċ-ċelluli T, li jippermettu lis-sistema immunitarja tiddistingwi bejn ċelluli awto u mhux. Il-molekuli HLA huma diversi ħafna u polimorfiċi, li jikkontribwixxu b'mod sinifikanti għal risponsi immuni individwali u suxxettibilità għal mard awtoimmuni u rifjut tat-trapjant.

2-hydroxy-4-methoxybenzyl huwa grupp li jipproteġi l-formamide aċidu labili użat għall-modifika riversibbli tas-sinsla fis-sinteżi tal-peptidi. Huwa inkorporat bħala aċidu amminiku jew dipeptide Fmoc-Hmb (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) matul is-sintesi tal-peptidi Fmoc f'fażi solida (SPPS), li jipprevjeni l-aggregazzjoni u jippermetti estensjoni effiċjenti tal-peptidi. Hmb jgħin ukoll fir-reazzjonijiet taċ-ċiklizzazzjoni u jipprevjeni l-formazzjoni ta 'asparagine.

L-Homoarginine huwa omologu ta 'L-arginine, imqassar bħala Har, u jista' jinstab fil-plażma u l-awrina. Homoarginine huwa r-riżultat ta 'guanidination ta' lysine, li jista 'jsir ukoll fuq peptidi u proteini.

Homocitrulline huwa omologu ta 'L-citrulline, imqassar bħala Hci, u jista' jiġi skopert fl-awrina umana.

L-homocysteine ​​huwa omologu ta 'cysteine, imqassar bħala Hcy, u huwa prodott mid-demethylation ta' methionine. Livelli elevati ta' Hcy fid-demm huma fattur ta' riskju għal mard kardjovaskulari u newrodeġenerattiv. B'kuntrast mad-derivattivi Cys, id-derivattivi Hcy ma jirraċemizzawx waqt l-akkoppjar, u lanqas -elimin.

Omoloġi ta' L-leucine, imqassar bħala Hle.

Homophenylalanine, omologu ta 'phenylalanine, imqassar bħala Hph, huwa komponent ta' inibituri ACE u renin. Fmoc-Homophe-OH huwa mediċina anti-infjammatorja potenzjali.

L-homoproline jew aċidu L-picolic, imqassar bħala Pip jew Hpr. L-omologu proline Hpr huwa prodott ta' degradazzjoni ta' L-lysine. Iż-żewġ enantiomeri jistgħu jiġu skoperti fil-plażma umana. Peress li r-residwi tal-prolina jinfluwenzaw b'mod qawwi l-konformazzjoni tal-peptide, is-sostituzzjoni ta 'Pro b'Hpr (jew azetidine-2-aċidu karboksiliku (Aze)) tista' timmodula l-istruttura sekondarja tagħha.

L-transhydroxyproline huwa prodott wara t-traduzzjoni bl-ossidazzjoni tal-proline. Hyp huwa komponent ewlieni tal-kollaġen u l-proteina tal-maskli.

Isoserine, isomer ta 'L-serine, huwa -amino acid.

ivDde, grupp li jipproteġi l-amino, jista 'jiġi deprotejat u maqsum minn 2% hydrazine hydrate f'DMF. ivDde huwa aktar stabbli minn Dde għal trattamenti ta' piperidine multipli frekwenti waqt Fmoc-SPPS. Nω-ivDde jista 'jitneħħa b'mod selettiv minn Dap, Dab Orn, jew Lys, u jippermetti modifika post-sintetika fuq ir-reżina tal-grupp Nω-amino.

Keyhole limpet hemocyanin (KLH) huwa metalloprotein multisubunit kbir li jġorr l-ossiġnu misjub fl-emolymph ta 'hemocyanin giant keyhole limpet. Bħala trasportatur tal-antiġenu, KLH normalment itejjeb l-immunoġeniċità u l-kapaċitajiet ta 'iffissar tal-antiġeni billi jgħaqqad sekwenzi polipeptidi fil-mira, u jippromwovi b'mod sinifikanti l-ġenerazzjoni ta' antikorpi effiċjenti, speċifiċi u funzjonali.

L-ormon li jirrilaxxa l-ormoni luteinizzanti (LHRH jew GnRH) huwa ormon decapeptide sintetizzat minn ċelloli newrosekretorji fi ħdan l-ipotalamu u rilaxxat b'mod pulsatile fiċ-ċirkolazzjoni portal pitwitarja. Is-sekrezzjoni pulsatile hija kritika għall-funzjoni riproduttiva, l-iżvilupp sesswali u d-divrenzjar.

Fid-disinn u s-sintesi tal-peptidi, ir-reserachers jistgħu jdaħħlu linker bejn il-bijotina jew fluworexxenti u l-peptidi. Spazjar idrofobiku komuni huwa aċidu aminohexanoic (Ahx), u spacer idrofiliku komuni huwa poly(ethylene) glycol (PEG).

Proċess ta 'tnixxif bil-friża, li jneħħi likwidu minn materjali sensittivi għas-sħana. Il-materjal huwa ffriżat, imqiegħed taħt vakwu għoli, u jinżamm f'temperaturi baxxi. Il-pressjoni maħluqa mill-vakwu tikkawża li s-silġ jinbidel minn stat solidu għal stat gassuż mingħajr ma jgħaddi mill-istat likwidu. Il-peptidi ġeneralment jitwasslu bħala trab lajofilizzat.

Kromatografija Likwida-Spettrometrija tal-Massa hija teknika analitika versatili li tintegra l-kromatografija likwida ma 'spettrometrija tal-massa biex tipprovdi informazzjoni dettaljata dwar il-kompożizzjoni u l-istruttura tal-molekuli f'kampjuni kumplessi.

Peptidi Antiġeniċi Multipli. Multiple Antigenic Peptide huwa mod wieħed qawwi biex jipproduċi antikorpi anti-peptidi ta 'titer għoli u vaċċini ta' peptidi sintetiċi.

Spettrometrija tal-Massa ta' Desorbiment/Ionizzazzjoni tal-Laser Assistita bil-Matriċi (MALDI-MS) hija teknika analitika użata biex tkejjel il-proporzjon tal-massa-ċarġ tal-joni. Huwa partikolarment utli għall-analiżi ta 'bijomolekuli bħal peptidi, proteini, u polimeri.

L-ispettrometrija tal-massa (MS) hija teknika analitika qawwija użata biex tkejjel il-proporzjon tal-massa-ċarġ (m/z) tal-joni.

4-Methoxy- -naphthylamide, imqassar bħala MNA, huwa fluworofor li ġeneralment ikun imwaħħal ma' substrat ta' carboxypeptidase fit-tarf C. 4M NA maqsum fi 335-350 nm u jarmi fi 410-440 nm

Methoxybenzenesulfonyl (Mbs) huwa grupp li jipproteġi guanidyl użat fis-sintesi tal-peptidi tal-fażi solida bbażata fuq Boc (Boc-SPPS). Dan il-grupp protettiv jista 'jiġi deprotejat permezz ta' qsim bil-fluworidu tal-idroġenu (HF).

4-Methylbenzyl (Mbzl) huwa grupp li jipproteġi sulfhydryl użat fis-sintesi tal-peptidi tal-fażi solida bbażata fuq Boc (Boc-SPPS). Mbzl huwa aktar stabbli minn methoxybenzyl (Mob) taħt trattamenti frekwenti ta 'aċidu trifluoroacetic (TFA) u jista' jitneħħa permezz ta 'qsim tal-fluworidu tal-idroġenu (HF).

(7-Methoxycoumarin-4-yl)acetic acid (Mca) huwa fluworofor li jista' jkun marbut ma' grupp amminiku.
Mca jingħaqad ma 'dinitrophenyl (Dnp) għal sottostrati tat-trasferiment tal-enerġija tar-reżonanza tal-fluworexxenza (FRET). Il-wavelength ta 'eċitazzjoni huwa 325 nm, u l-wavelength ta' emissjoni huwa 392 nm.

L-ormon li jikkonċentra l-melanin (MCH) huwa newropeptide ċikliku iżolat l-ewwel mill-ħut u l-firien. L-MCH huwa primarjament involut fir-regolazzjoni tal-pigmentazzjoni tal-ġilda fil-ħut teleost u l-imġieba tal-għalf fil-mammiferi.

Il-metil, l-aktar sostituent alkil sempliċi, huwa involut f'N-, O-, u S-methylation, li jikkostitwixxu modifiki permanenti tal-peptide.

3-Methoxysuccinyl, li jikkorrispondi għal Asp(OMe) deaminat, huwa grupp polari ta' imblukkar N-terminal inkorporat b'mod komuni fis-sottostrati tal-carboxypeptidase.

Il-metilazzjoni hija modifika ta' wara t-traduzzjoni (PTM) ta' peptidi u proteini fejn grupp tal-metil (-CH3) huwa miżjud b'mod enżimatiku ma' residwi speċifiċi ta' aċidi amminiċi, komunement lysine (Lys), arginine (Arg), histidine (His), jew glutamate ( Glu). Din il-modifika tista 'tinfluwenza b'mod sinifikanti l-funzjoni tal-proteini, l-istabbiltà, u l-interazzjonijiet ma' molekuli oħra, u b'hekk ikollha rwoli ċentrali fir-regolazzjoni ta 'proċessi ċellulari diversi inklużi l-espressjoni tal-ġeni, it-trasduzzjoni tas-sinjali u l-interazzjonijiet proteina-proteina.

Il-kumpless maġġuri tal-istokompatibilità (MHC) huwa reġjun ġenetiku li fih ġeni li jikkodifikaw molekuli MHC. Dawn il-molekuli għandhom rwol kruċjali fis-sistema immuni u fl-awtoimmunità. Fil-bnedmin, dan il-kumpless huwa magħruf ukoll bħala s-sistema tal-antiġen tal-lewkoċiti umani (HLA).

Il-molekuli MHC tal-klassi I (MHC I) huma proteini fuq l-uċuħ taċ-ċelluli li jippreżentaw peptidi minn ġewwa ċ-ċellula għal ċelluli T ċitotossiċi. Dan jgħin liċ-ċelloli immuni jagħrfu u jeqirdu ċelloli infettati jew anormali, kruċjali għad-difiża immuni kontra l-patoġeni u l-kanċer.

Il-molekuli tal-klassi MHC II (MHC II) huma proteini tal-wiċċ taċ-ċelluli li jippreżentaw peptidi derivati ​​minn sustanzi barranin għal ċelluli T helper. Din l-interazzjoni hija essenzjali għall-koordinazzjoni tar-risponsi immuni u l-attivazzjoni ta 'ċelluli immuni oħra kontra patoġeni.

L-arginina monometilata (MMA) hija modifika ta' wara t-traduzzjoni fejn grupp tal-metil wieħed (-CH3) huwa miżjud b'mod enżimatiku man-nitroġenu guanidino ta' residwu ta' l-arginina fi ħdan peptide jew proteina.

3-mercaptopropylamine, jista 'jintuża bħala ligand peptide jew modifikatur f'diversi applikazzjonijiet bijokimiċi u bijomediċi.

Myristoylation huwa proċess ta' modifika tal-lipidi fejn grupp myristoyl, li jikkonsisti f'{0}}aċidu xaħmi saturat tal-karbonju, huwa marbut b'mod kovalenti mat-tarf N tal-peptide. Din il-modifika sservi biex takkra l-proteina mal-membrana taċ-ċellula, u tiffaċilita l-lokalizzazzjoni tagħha u l-parteċipazzjoni fi proċessi ċellulari diversi.

-(1-naphthyl)-L-alanine huwa derivattiv ta 'aċidu amminiku mhux polari simili għal phenylalanine, iżda bi grupp naphthyl minflok grupp fenil.

-(2-Naphthyl)alanine huwa derivattiv ta' aċidu amminiku mhux polari simili għal phenylalanine, iżda bi grupp naphthyl minflok grupp fenil.

3-nitrobenz-2-oxa-1, 3-diazole (NBD) normalment jiġi introdott billi r-reaġent NBD-Cl jiġi kkonjugat mal-peptide. Peptidi ttikkettjati NBD huma magħżula b'mod wiesa 'għall-utilità tagħhom fi studji li jiffokaw fuq membrani u bijoloġija taċ-ċelluli.

N-Ethylamide jista 'jitqies bħala forma decarboxylated ta' C-terminal alanine. Fil-buserelin agonist LHRH, NHEt iservi bħala analogu ta 'glycinamide C-terminal. Peptide N-ethylamide huwa reżistenti għad-degradazzjoni minn carboxypeptidases.

L-norleucine (Nle) huwa isostere stabbli ta 'L-methionine. Meta l-attività bijoloġika ta 'peptide tiġi kompromessa minħabba l-formazzjoni ta' sulfoxide, Nle jista 'jiġi sostitwit għal Met mingħajr ma tipikament tbiddel l-imġieba funzjonali tiegħu.

NOTA, 1,4,7-triazacyclonone-1,4,7-aċidu triaċetiku, huwa kelatur bifunzjonali li jservi bħala qafas għall-bini ta' għodod tal-immaġini tal-PET. Huwa wkoll utilizzat fid-disinn tas-sonda u l-amplifikazzjoni tas-sinjal permezz ta 'effetti multivalenti u jżomm applikazzjonijiet potenzjali bħala radjufarmaċewtiku tal-gallju dijanjostiku.

N-Me normalment jirreferi għal N-metilazzjoni, modifika kimika li fiha grupp tal-metil (-CH 3 ) huwa mwaħħal ma 'atomu ta' nitroġenu fil-molekula, bħal N-Me-Gly, N-Me-Ser, N-Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me -Val, N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva, eċċ.

NODAGA,1,4,7-triazacyclonone,1-aċidu glutariku-4,7-aċidu dijaċetiku, huwa kelatur bifunzjonali eċċellenti għad-disinn u l-iżvilupp ta' radjofarmaċewtiċi organometalliċi, li joffri sinifikanti potenzjal għal applikazzjonijiet fl-immaġini dijanjostiċi u radjuterapija mmirata.

2-Nitrophenylthio (Nps) huwa grupp li jipproteġi S użat fis-sintesi tal-peptidi tal-fażi solida bbażata fuq Boc (Boc-SPPS). Jista 'jinqasam minn thiols, speċifikament permezz tal-grupp sulfhydryl ħieles ta' cysteine ​​(Cys), li jwassal għall-formazzjoni simultanja ta 'bond disulfide.

Neuropeptide Y (NPY) huwa newropeptide prominenti fil-moħħ u parti mill-familja newropeptide Y, li jinkludi polypeptide pankreatiku (PP) u peptide YY (PYY).

2-Nitro-2-pyridylsulfenyl (Npys) huwa grupp li jipproteġi S li huwa kompatibbli mas-sintesi ta' peptidi ta' fażi solida bbażata fuq Boc (Boc-SPPS). Npys jista 'jinqasam minn thiols, speċifikament permezz tal-grupp sulfhydryl ħieles ta' cysteine ​​(Cys), li jirriżulta fil-formazzjoni simultanja ta 'bond disulfide.

Norvaline huwa aċidu amminiku alifatiku mhux polari u omologu ta 'aċidu -aminobutyric (Abu).

-Naphthylamide huwa fluorophore komunement użat fis-sottostrati tal-carboxypeptidase, tipikament marbut fil-C-terminal tal-peptidi. NA maqsuma eċita fi 330 nm u temetti fi 370 nm.

-Naphthylamide huwa fluorophore komunement użat fis-sottostrati tal-carboxypeptidase, tipikament marbut fil-C-terminal tal-peptidi. NA maqsum fi 320-340 nm, emissjoni fi 410-420 nm.

Allyl ester huwa grupp li jipproteġi carboxyl li huwa kompatibbli kemm mas-sintesi tal-peptidi f'fażi solida bbażata fuq Fmoc u Boc (SPPS). Simili għal Aloc, l-esteri allyl jistgħu jitneħħew b'mod selettiv bi trattament b'Pd(PPh3)4. F'Fmoc-SPPS, Asp(OAll) huwa suxxettibbli għall-formazzjoni katalizzata mill-bażi ta' aspartimide.

Benzyl ester, grupp li jipproteġi l-karbosili, jista 'jitneħħa permezz ta' idroġenazzjoni katalitika (eż. H2/Pd) jew aċidi qawwija.

OcHex huwa l-grupp li jipproteġi karbossili standard użat fis-sintesi tal-peptidi tal-fażi solida bbażata fuq Boc (Boc-SPPS).

4-(N-[1(4,4-Dimethyl-2,6-dioxocyclohexyliden)-3-ethylbutyl]amino)benzyl ester (ODmab) huwa karbossili li jipproteġi grupp użat fis-sintesi tal-peptidi tal-fażi solida bbażata fuq Fmoc (Fmoc-SPPS). Jista 'jinqasam u jitneħħa l-protezzjoni bl-użu ta' 2% hydrazine hydrate f'DMF.

2,4-Dimethoxybenzyl ester huwa grupp li jipproteġi l-karboxil labili ħafna aċidu li jista 'jitneħħa bl-użu ta' 1% TFA fid-dichloromethane.

Ester etiliku, Minħabba l-kundizzjonijiet stretti meħtieġa għat-tneħħija ta 'esteri etiliċi, peptidi li jimmodifikaw b'esteri etiliċi jistgħu jtejbu l-lipofiliċità u l-istabbiltà tagħhom.

9-Fluorenylmethyl ester huwa grupp li jipproteġi l-karboxil li jista' jitneħħa bl-użu ta' piperidine fid-DMF.

Hexyl esteri, Minħabba l-kundizzjonijiet stretti meħtieġa għat-tneħħija ta 'esteri etiliċi, peptidi li jimmodifikaw b'esteri etiliċi jistgħu jtejbu l-lipofiliċità u l-istabbiltà tagħhom.

L-Otahydroindole-2-aċidu carboxylic (Oic) huwa aċidu amminiku mxekkel mhux polari. L-inserzjoni ta 'dan l-aċidu amminiku relatat mal-prolina fis-sekwenza tal-polypeptide taffettwa bil-qawwa l-konformazzjoni tal-peptide.

L-esteri tal-metil huma gruppi protettivi semi-permanenti C-terminal f'sintesi ta 'fażi likwida, u jistgħu jiġu kkonvertiti f'hydrazides peptidi, prekursuri ta' ażidi peptidi reattivi. L-akkoppjar ta 'l-azide jibqa' l-aktar metodu ta 'akkoppjar ta' frammenti popolari fis-sintesi tal-peptidi tal-fażi likwida.

3-Methylpent-3-yl ester (OMpe) huwa grupp li jipproteġi l-karbossil labili fl-aċidu spiss użat biex jipproteġi l-grupp karbossiliku tal-aċidu aspartiku (Asp) fis-sintesi tal-peptidi f'fażi solida bbażata fuq Fmoc (Fmoc-SPPS). ).Dan l-analogu ta 'tert-butyl ester aktar steriku eżiġenti ġie żviluppat speċifikament biex inaqqas il-formazzjoni ta' asparagimide katalizzata b'bażi.

Esteri orto-nitrophenyl ta 'Boc- jew Z-amino acids huma derivattivi preattivati ​​użati fis-sintesi ta' soluzzjoni ta 'peptidi.

Ornithine (Orn) huwa prodott mill-arginine matul iċ-ċiklu tal-urea u jista 'jiġi osservat ukoll fil-peptidi bħala prodott ta' degradazzjoni tal-arginine. Il-formazzjoni ta 'Orn permezz ta' aċilazzjoni tal-parti guanidine ta 'arginine hija reazzjoni sekondarja komuni fis-sintesi tal-peptidi.

Hydroxysuccinimide ester (OSu, imqassar bħala NHS) huwa derivattiv ta 'aċidu amminiku preattivat li huwa komunement użat fis-sintesi tal-peptidi, speċjalment il-modifika tal-peptidi. L-esteri OSu huma sikuri, mhux steriċi, kompatibbli ma 'sistemi milwiema u faċli biex jimmaniġġaw.

Tert-butyl ester, grupp li jipproteġi l-karboxil labile-aċidu għal aċidi amminiċi fis-sintesi tal-peptidi.

4-aċidu aminobenzoic (aċidu para-aminobenzoic), Jista 'jintuża biex għas-sintesi ta' linkers konjugat antikorp-droga. Pereżempju, Mal-PEG2-Val-Cit-PABA huwa linker tal-konjugat tad-droga tal-antikorpi li jista 'jinqasam (ADC).

PABC (para-aminobenzyl carbamate) huwa kompost kimiku użat fis-sintesi ta 'konjugati antikorpi-droga (ADCs) bħala linker. Jiffaċilita t-twaħħil ta 'mediċini ma' antikorpi b'mod ikkontrollat, li jippermetti twassil immirat tad-droga f'terapiji tal-kanċer u applikazzjonijiet bijomediċi oħra. Pereżempju, Mc-Val-Cit-PABC-PNP huwa linker li jista' jinqasam minn cathepsin użat f'konjugati ta' antikorpi-droga (ADCs).

Pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (PACAP) huwa newropeptide kkonservat ħafna espress b'mod prominenti fil-moħħ tal-mammiferi. Jeżerċita l-effetti bijoloġiċi tiegħu billi jsaħħaħ il-livelli ta 'AMP ċikliku intraċellulari permezz ta' interazzjoni tar-riċetturi.

Palmitoyl, grupp aċil mhux polari introdott fl-N-terminal jew fil-ġenb. Palmitoylation ġiet osservata wkoll bħala modifika ta 'wara t-traduzzjoni tal-proteini.

Phenylacetamide methyl resin hija reżina ddisinjata speċifikament għas-sintesi tal-peptidi tal-fażi solida bbażata fuq Boc (Boc-SPPS). Peptidi sintetizzati fuq din ir-reżina jistgħu jiġu rilaxxati bl-użu ta 'qsim HF.

Fil-Konjugati Antikorp-Droga (ADCs), il-linker jgħaqqad l-antikorp mat-tagħbija ċitotossika. L-għażla tat-tagħbija hija kritika peress li tiddetermina l-effettività u l-ispeċifiċità tal-ADCs fit-twassil tat-terapija għat-tessuti fil-mira permezz ta 'mekkaniżmi speċifiċi ta' rilaxx.

2,2,4,6,7-Pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfonyl (Pbf) huwa l-grupp li jipproteġi guanidino preferut użat fis-sintesi tal-peptidi f'fażi solida bbażata fuq Fmoc (Fmoc-SPPS). Hija tesibixxi kemmxejn ogħla acid-lability meta mqabbel ma 'Pmc.

Penicillamine hija analoga ta 'L-cysteine ​​ikkaratterizzata mis-sostituzzjoni ta' grupp metil (-CH3) b'aċidu karbossiliku (-COOH).

L-awto-assemblaġġ tal-peptidi huwa meta l-peptidi jirranġaw lilhom infushom b'mod naturali fi strutturi ordnati mingħajr intervent estern. dan il-proċess huwa mmexxi minn interazzjonijiet mhux kovalenti bħall-irbit tal-idroġenu, interazzjonijiet idrofobiċi, forzi elettrostatiċi, u stivar π-π. L-awto-assemblaġġ tal-peptidi jista 'jwassal għall-formazzjoni ta' diversi nanostrutturi inklużi fibri, sferi, folji u ġellijiet, li għandhom applikazzjonijiet fix-xjenza tal-materjali, il-bijoteknoloġija u l-mediċina.

Phenylacetyl (Phenylac jew Phac) huwa grupp acyl tipikament marbut fit-tarf N tal-peptidi, ikkaratterizzat minn polarità aktar baxxa meta mqabbel ma 'acetyl (Ac). Jikkostitwixxi modifika permanenti tal-peptidi.

phenylglycine (Phg) huwa derivat tal-aċidu amminiku fejn grupp fenil jissostitwixxi l-atomu tal-idroġenu fil-molekula tal-gliċina

Peptide Histidine Isoleucine (PHI), peptide porċin relatat ma 'VIP u secretin.

Peptide histidine methionine (PHM), peptide uman relatat ma 'VIP.

Il-punt iżoelettriku (pI) huwa definit bħala l-livell ta 'pH li fih il-proteina/peptide għandha ħlas nett ta' żero (Smoluch et al., 2016).

2,2,5,7,8-Pentamethylchroman-6-sulfonyl (Pmc) huwa grupp li jipproteġi guanidinyl użat komunement fis-sintesi tal-peptidi f'fażi solida bbażata fuq Fmoc (Fmoc-SPPS). Huwa nnutat li huwa kemmxejn inqas labile fl-aċidu meta mqabbel ma 'Pbf.

p-Nitroaniline, kromoforu, huwa tipikament konjugat mat-terminal C tas-sottostrati tal-carboxypeptidase. L-assorbiment tal-p-nitroaniline liberat huwa komunement imkejjel f'wavelengths madwar 405 jew 410 nm.

L-Propargylglycine (Pra) huwa prodott minn mikro-organiżmi. Dan l-aċidu amminiku, ikkaratterizzat mill-istruttura ta 'triple-bond tiegħu, huwa meqjus ħafna bħala unità bażika għas-sintetizzazzjoni ta' peptidi li kapaċi jimpenjaw ruħhom f'reazzjonijiet ta '"kimika tal-ikklikkja", u jiġbdu attenzjoni sinifikanti fil-qasam.

L-ormon tal-paratirojde (PTH) huwa ormon peptidiku rilaxxat mill-glandoli tal-paratirojde, kruċjali għaż-żamma tal-omeostażi tal-kalċju u tal-fosfru fil-fluwidu extraċellulari.

Modifiki ta 'wara t-traduzzjoni (PTMs) ta' proteini jżidu gruppi funzjonali jew proteini, jaqtgħu subunitajiet regolatorji, jew ikissru proteini sħaħ. Dawn il-bidliet, bħall-fosforilazzjoni, glikosilazzjoni, metilazzjoni, aċetilazzjoni, lipidazzjoni, ubikwitinazzjoni, nitrosilazzjoni u proteoliżi, jaffettwaw kif iċ-ċelloli jaħdmu b'mod normali u waqt il-mard. Il-fehim tal-PTMs huwa kruċjali għar-riċerka bażika u biex jinstabu trattamenti ġodda.

aċidu piroglutamiku, magħruf ukoll b'abbrevjazzjonijiet bħal Pgl, Glp, pGlu, jew

phenylazobenzylmethoxycarbonyl huwa grupp kromoforiku li jipproteġi N użat fis-sintesi tal-peptidi, li jista 'jinqasam permezz ta' idroġenazzjoni katalitika jew aċidu qawwi. Jesibixxi wavelengths massimi ta 'assorbiment f'229 nm, 320 nm, u 441 nm.

Par quencher jikkonsisti minn molekula fluworexxenti (fluorophore) u molekula quencher użata fir-riċerka u l-analiżi bbażati fuq il-fluworexxenza. Il-quencher jassorbi d-dawl emess mill-fluworophore, u jnaqqas il-fluworexxenza tiegħu. Meta l-fluworophore u quencher jiġu separati, bħal permezz ta 'reazzjoni bijokimika, is-sinjal tal-fluworexxenza jiżdied. Dan jippermetti lir-riċerkaturi jkejlu l-bidliet u l-interazzjonijiet f'ħin reali. Din it-teknika tintuża komunement f'applikazzjonijiet bħal PCR f'ħin reali, sondi molekulari, u analiżi FRET (Förster Resonance Energy Transfer).

Il-fluworin-18 huwa radjuligand użat komunement fl-immaġini tal-PET biex jevalwa l-metaboliżmu tal-glukożju fit-tessuti u huwa użat komunement fid-dijanjosi tal-kanċer u l-immaġini tal-moħħ.

Librerija tal-peptidi każwali hija ġabra ta 'ħafna sekwenzi qosra ta' peptidi ġġenerati b'mod każwali. Kull peptide fil-librerija għandu numru speċifiku ta 'aċidi amminiċi b'sekwenzi determinati b'mod każwali, li joħolqu firxa diversa ta' molekuli peptidi. Ir-riċerkaturi jużaw dawn il-libreriji biex jeżaminaw peptidi bi proprjetajiet speċifiċi, attivitajiet bijoloġiċi, jew interazzjonijiet ma 'molekuli fil-mira. Huma speċjalment utli fl-iskoperta tad-droga, l-immunoloġija, u studji ta 'interazzjonijiet proteini-proteini, jgħinu biex jiġu identifikati terapewtiċi ġodda u jifhmu proċessi bijoloġiċi kumplessi.

Residwu huwa aċidu amminiku individwali fi ħdan peptide jew proteina. Hekk kif l-aċidi amminiċi jingħaqdu flimkien permezz ta' rabtiet peptidi biex jiffurmaw dawn il-ktajjen, kull unità ta' aċidi amminiċi tissejjaħ residwu. Dan it-terminu jintuża minħabba li matul il-formazzjoni tar-rabta tal-peptide, kull aċidu amminiku jitlef molekula tal-ilma (H2O), u jħalli warajh dak li jissejjaħ residwu.

Ir-reżina hija polimeru li ma jinħallx użat fis-sintesi tal-peptidi ta 'fażi solida (SPPS) bħala appoġġ solidu għaż-żieda kontinwa ta' aċidi amminiċi. Żibeġ tar-reżina jipprovdu wiċċ stabbli u inert li miegħu l-aċidi amminiċi inizjali huma mwaħħla b'mod kovalenti, li jippermettu li l-katina tal-peptidi tinbena residwu b'fdal.

Rhodamine B hija żebgħa roża jgħajjat ​​għal ħamra b'tul ta' mewġ ta' eċċitazzjoni ġeneralment madwar 540-570 nm u medda ta' dawl emess ta' 560-580 nm. Normalment ikun konjugat mas-sekwenza tal-peptidi permezz tal-grupp amminiku N-terminal tal-peptide

Kromatografu likwidu ta' prestazzjoni għolja b'fażi inversa.

Drogi ta' Relazzjoni Struttura-Attività (SAR) huma żviluppati billi tistudja r-relazzjoni bejn l-istruttura kimika ta' droga u l-attività bijoloġika tagħha.

Sarcosine, l-aktar sempliċi aċidu amminiku N-alkylated.

Dimethylarginine simetriku (SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (simmetriku) jista 'jintuża direttament għas-sintesi ta' peptidi li fihom dimethylarginine simmetriku.

Is-sintesi tal-peptidi tal-fażi solida (SPPS) hija metodu għas-sintesi kimika tal-peptidi, fejn il-peptidi huma mmuntati pass pass fuq appoġġ solidu jew reżina billi żżid sekwenzjali aċidi amminiċi protetti. SPPS jinkludi żewġ strateġiji: Fmoc-SPPS u Boc-SPPS, li huma differenti fl-għażla ta 'gruppi ta' protezzjoni tal-grupp N -amino (Fmoc jew Boc) u gruppi ta 'protezzjoni tal-katina tal-ġenb. It-tip ta 'grupp protettiv N -amino magħżul jiddetta l-istrateġija tal-protezzjoni tal-katina tal-ġenb u l-kundizzjonijiet għall-qsim finali tal-peptide mir-reżina.

Statine, imqassar bħala Sta, huwa aċidu amminiku mhux proteini li ħafna drabi jintuża fid-disinn ta 'mimetiċi tal-peptidi, speċjalment fis-sintesi ta' inibituri tal-protease.

Tert-Butylthio (StBu) huwa grupp li jipproteġi S li jinqasam bit-tnaqqis tal-fosfina u huwa kompatibbli ma 'Boc-SPPS.

Succinyl huwa modifika N-terminal polari li tikkorrispondi ma 'aspartate deaminat u hija tipikament inkorporata fis-sottostrati carboxypeptidase.

TAMRA, imqassar ukoll bħala TMR, huwa fluorophore li jista 'jitwaħħal ma' grupp amminiku. Ħafna drabi jintuża flimkien ma 'FAM għal sottostrati FRET. TAMRA għandu wavelength ta 'eċitazzjoni ta' 485 nm u wavelength ta 'emissjoni ta' 535 nm.

Tert-butyl huwa grupp li jipproteġi l-aċidu-labili użat komunement għall-alkoħol u l-fenoli, li jista 'jinqasam bl-użu ta' aċidu trifluoroacetic (TFA).

Il-fosfat tat-trietilammonju huwa buffer użat fil-fażijiet mobbli HPLC b'fażi inversa.

Aċidu trifluoroacetic (TFA) intuża għall-qsim tal-peptide mir-reżina f'Fmoc-SPPS u għat-tneħħija ta 'gruppi protettivi derivati ​​minn tBu.

L-aċidu trifluoromethanesulfonic (TFMSA) huwa aċidu aktar b'saħħtu minn TFA. TFMSA jista 'jintuża bħala alternattiva aktar sigura għall-HF tossiku ħafna għall-pass finali tal-qsim tal-istrateġija Boc-SPPS.

L-tert-leucine (Tle) huwa aċidu amminiku mhux polari b'ktajjen tal-ġenb sterikament eżiġenti li jiddestabilizza l-helizes.

2,4,6-Trimethoxybenzyl huwa grupp li jipproteġi l-Asn u Gln amide aċidu labbli użat f'Fmoc-SPPS.

Tosyl jintuża bħala grupp protettiv għal guanidine u imidazole f'Boc-SPPS, u jista' jitneħħa minn Na/NH3

Trityl (Trt) huwa grupp li jipproteġi l-aċidu labili użat għal residwi Asn, Cys, Gln, u His f'Fmoc-SPPS. Jista 'jitneħħa b'mod selettiv bl-użu ta' aċidu trifluworoaċetiku (TFA).

Peptidi puri tipikament jeżistu fi stat ta 'trab abjad wara t-tnixxif bil-friża.

Vasoactive intestinal peptide (VIP) huwa 28-peptide ta' aċidu amminiku li jappartjeni għas-superfamilja ta' glucagon-ghrelin-secretin peptide.

9-Xanthydryl (Xan) huwa grupp li jipproteġi l-amide aċidu labili użat għal residwi Asn u Gln f'Boc-SPPS. Xan jista 'jitneħħa b'mod selettiv bl-użu ta' TFA.

Meta l-peptide jiġi ttikkettjat bil-fluworexxeina FAM, it-trab lajofilizzat tipikament juri dehra safra.

Z-benzyloxycarbonyl, imqassar bħala Z jew Cbz, jintuża bħala grupp li jipproteġi l-amino fis-sintesi tal-peptidi. Jista 'jitneħħa bl-użu ta' idroġenoliżi jew aċidi qawwija bħala HF pulita jew HBr/aċidu aċetiku.